西安瑞禧最近開拓了新的科研方向——計算機輔助藥物設(shè)計,其中包括藥物發(fā)現(xiàn)、藥物靶點預(yù)測、藥物靶標發(fā)現(xiàn)、先導(dǎo)化合物篩選、藥物設(shè)計服務(wù)、靶標預(yù)測服務(wù)、藥物虛擬篩選、藥物/小分子定制合成、化合物結(jié)構(gòu)優(yōu)化活性/藥物篩選、虛擬新藥篩選服務(wù)。本文小編主要介紹的是:藥物發(fā)現(xiàn)、藥物靶點預(yù)測。
新藥研制成功的關(guān)鍵在于藥物靶點的發(fā)現(xiàn)和準確定位.在已知的藥物靶點中,離子通道蛋白是一類廣受歡迎的靶點,它與免疫系統(tǒng)、心血管等疾病密切相關(guān).對于靶點的發(fā)現(xiàn),傳統(tǒng)生物方法成本高、耗時久.因此,探討了基于機器學(xué)習(xí)的離子通道蛋白藥物靶點的挖掘,以加快藥物靶點發(fā)現(xiàn)過程,節(jié)約經(jīng)費.由于藥物靶點相關(guān)序列的長度不一致,考慮了蛋白質(zhì)序列編碼的13種特征,它們能將不等長的蛋白質(zhì)序列轉(zhuǎn)化成等長序列.通過數(shù)值實驗篩選能夠較好地區(qū)分靶點和非靶點的特征子集,并采用集成學(xué)習(xí)的方法整合特征得到預(yù)測模型.通過與已有工作的比較表明,提出的集成模型能得到較高的準確率,具有很好的應(yīng)用前景.
瑞禧計算機輔助藥物設(shè)計相關(guān)方向:
藥物發(fā)現(xiàn) 藥物靶點預(yù)測
藥物靶標發(fā)現(xiàn) 先導(dǎo)化合物篩選
藥物設(shè)計服務(wù) 靶標預(yù)測服務(wù)
藥物虛擬篩選
藥物/小分子定制合成
化合物結(jié)構(gòu)優(yōu)化
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